FileDirector funciona a la perfección con Microsoft Active Directory, lo que permite que la administración de usuarios continúe de la misma manera sin crear nuevos inicios de sesión.
Si esta integración no se desea o no es posible, FileDirector ofrece su propio sistema de gestión de usuarios. El formato de las contraseñas se puede establecer mediante el uso de expresiones regulares para la validación.
Debido a que el servidor FileDirector usa IIS, puede cifrar los datos enviados y recibidos con una clave de 128 bits y certificados de seguridad.
Todas las actividades realizadas en el sistema se registran en la pista de auditoría. Y para cada documento se almacena un historial individual de todas las acciones del usuario.